深海魚油當中的DHA成分是腦細胞形成發育不可缺少的物質，它是另一種特殊的不飽和脂肪酸，有健腦益智的作用。因此DHA所扮演的角色是,促進、協調神經回路傳導作用，以維持腦部細胞的正常運作，從而增強集中力、記憶力、注意力。保障血流暢通，深海魚油中的EPA成分是一種特殊的不飽和脂肪酸，是有益于血液循環的保護因子。EPA可協助清除附著于血管壁上的膽固醇與硬化斑，降低血液中膽固醇水平，有助于保持血液暢通流動，抑制不正常血液凝集、預防血栓產生，阻止中風或心肌梗塞的發生。

EPA和DHA還具有抗炎活性。當人體攝入的Ω-6-脂肪酸(植物油中通常大量含有)過多而Ω-3-脂肪酸不足時，機體就會產生一些化學物質導致炎性反應。深海魚油中的EPA與DHA則可以平衡過多的Ω-6-脂肪酸，因此魚油常被用于改善各種炎癥如類風濕性關節炎等。

EPA和DHA與情緒平衡有密切的關系。當血液中的EPA和DHA的濃度偏低時，發生輕～中度憂郁癥的幾率會明顯提高。有實驗表明，和不喜歡吃魚的人比較，喜歡吃魚的人面對困難更加積極樂觀。這主要是魚當中含有的EPA與DHA可以改善情緒。

深海魚油中的“多烯酸乙酯”具有明確的降血脂、預防冠心病的效果，包含的EPA-E和DHA-E幫助促進血液循環及消除疲勞，清除血管內的垃圾，預防和治療高血壓。