仲尼式古琴和伏羲式古琴的區別在于樣式不同?！扒佟奔粗袊徘偈亲顬楣爬系南覙窐菲?，音域寬廣，音色深沉，余音悠遠，千百年來一直是中國古代文人、士大夫手中愛不釋手的器物。特殊的身份使得琴樂在整個中國音樂結構中屬于具有高度文化屬性的一種音樂形式。在人們經見的琴式中，計有伏羲式、靈機式、神農式等等，而最為常見的，則是仲尼式。
古代造琴基本分為三類：一是圣人造琴，如仲尼式、神農式、伏羲式等;二是文人造琴，如落霞式、蕉葉式、連珠式等;三是帝王造琴，如襄王琴、潞王琴等。琴的式樣是造琴人根據自己的審美趨向通過對琴身的變異而展示和發揮自己的藝術特色形成的，因此每一種琴的式樣都反映出它自身的思想語言。
仲尼式是古琴中最常見的一款樣式，它是屬于圣人造琴的一類，由于它的名字叫“仲尼”，所以會讓人馬上聯想到孔子，誰也說不清這種式樣是否是孔子設計的，但是以“仲尼”命名的確很恰當，因為它是在所有琴里最簡捷的一種，只在琴體的腰部和頭部有兩個凹進的線條，通體沒有任何其他的修飾，他的簡捷而流暢、含蓄而大方的造型最能體現儒家思想的中庸內斂的風格。
仲尼，即孔子，儒家思想的杰出代表，一位影響中國數千年的哲人。有人曾這樣評價他：“天不生仲尼，萬古如長夜?！庇捎诳子趯徘俚奶岢?，文人中彈琴的風氣很盛，并逐漸形成古代文人，必須備“琴、棋、書、畫”修養的傳統?？鬃釉谔岢贅分蹙徒虒дf君子樂不去身，君子和琴比德，唯君子能樂。操琴通樂是君子修養的最高層次，人與樂合一共同顯現出一種平和敦厚的風范。在孔子的時代，琴樂還不僅僅是后世的君子個人的修身之樂，更是容納天地教化百姓的圣樂。于琴樂之中，孔子聽到了文王圣德之聲，師曠聽出了商紂亡國之音，故古琴也稱之為“圣人之器”。
