吳君如與歌手杜德偉拍過拖，及后在臺灣綜藝節目《康熙來了》亦有承認。吳君如在陳可辛之前，曾跟杜德偉拍拖過，不過最后兩個人的感情是無疾而終。吳君如自從1992年和男友分手后，有五年沒有談戀愛。她心目中的男人是那種高大威猛的類型，她怎么都沒有想到最后走進自己生命中的竟然是溫柔、書卷氣十足的陳可辛。也許這就叫做緣分。

1990年認識了現在“香港十大導演”之一的陳可辛導演，兩人從相識相知到相愛經歷了一段漫長的長跑，吳君如說他的浪漫只會出現在電影作品里。

陳可辛爆料吳君如這個類型的女生并不是自己喜歡的類型，可就是這個愛笑愛鬧的女生因為一杯水就走進了大導演的心中并預言你很快就會紅的。

2004年吳君如和陳可辛開始了一段同居生活，80平方米的臥房被一塊木門分割成兩間，有共同生活也有各自的隱私，也許是因為不漂亮女孩的不自信，也許這樣才能減少摩擦期的碰撞。之后吳君如在2006年生下女兒陳是知，陳可辛也在2007年電影《投名狀》的首映典禮上挽著吳君如走過紅毯。

所以陳可辛是吳君如的第一任老公，吳君如也只有陳可辛這一個老公。十年的愛情長跑，十年的相思相守，愿所有愛情都有圓滿的結局可以長長久久。

吳君如說其實我都沒有時間出去玩，度假時碰到的很多都是有女朋友的。可能是我要求比較高吧，反正我是發覺身邊沒有人追求我。

對陳可辛吳君如這樣看：當時沒想過，那時只是逛逛街，玩玩啊，沒什么感覺。因為我喜歡特別高、特別壯的那種，陳可辛不是，他的外表像我的內心那么溫柔。但是現在我非常愛他，他非常有才華，很有修養的，我非常崇拜他。我們現在和結婚是沒有分別的，只是差生孩子而已。我們覺得只有想要孩子了才會結婚，他特別希望將來有時間陪他的孩子，可是他現在真的忙得不得了。