大日如來不是如來佛祖，大日如來和如來佛祖雖然都是佛，但大日如來是法身佛，如來佛祖是應身佛，這是最本質的區別。大日如來又叫做比盧遮那佛，是密宗最崇高的佛，當然這也就意味著大日如來是一切佛法的根本。“如來”就是“佛”的意思，人們平時說起的大日如來出現在公園七世紀，出自《大日經》中，而“大日”又是什么意思呢?是除卻一切黑暗照耀宇宙萬物，所謂的大日之光，就是永生永滅。
除此之外，在《大日輕疏》中有這樣的記載：大日如來普照法界，能開發眾生的慧根，使得世間事業得以成功。那么如來佛祖又是怎樣的呢?如來佛祖其實就是佛教的教祖釋迦摩尼，原名喬達摩·悉達多，被后世尊稱為佛陀世尊等等。試想，一個古印度國家的王子，能舍棄貴族優越的生活，出家修行，本就是一件不容易的事情，悉達多還愿意每天思考人世間的生老病死等問題，終于，在他35歲的時候，菩提樹下的悉達多，大徹大悟，因此創立了佛教，之后開始到處傳教，普渡眾生，在悉達多八十歲那年涅槃成佛。
如來佛，是一切佛的通稱，一切佛都可以稱為如來，如來是乘如實之道而來，無所從來亦無所去故稱如來。一切佛都可以稱如來，這是十大稱號之一，如釋迦牟尼佛，可以稱為釋迦如來，阿彌陀佛也叫阿彌陀如來，藥師佛可以叫藥師如來等等。
所謂的如來佛祖一般指釋迦牟尼如來，為婆娑世界（即我們所處的世界）的佛教教主，我們這個世界只能有一個佛，過去是燃燈、現在是釋迦牟尼、未來是彌勒。釋迦牟尼是佛教的創立者，是古代中印度迦毗羅衛國的釋迦族人，我們常說的釋迦牟尼佛是化身佛即應身佛，是表示隨緣教化，濟度世間蕓蕓眾生而現的佛身，特指釋迦牟尼的生身。
佛有三身，即法身、報身、應身三種佛身，又叫自性身、受用身、變化身。所謂理法聚而為法身，智法聚而為報身，功德法聚而應身。因一佛具三身之功德性能，所以三身即一佛。法身佛（毗盧遮那佛）代表佛教真理（佛法）凝聚所成的佛身。報身佛（盧舍那佛）經過修習得到佛果，享有佛國（凈土）之身。應身佛（又稱化身佛，即釋迦牟尼佛）指佛為超度眾生、隨緣應機而呈現的各種化身。
