養魚先養水，這里叫做跑水。跑水就是在過濾設備安裝完畢后將魚缸加滿水，然后開啟過濾器，讓水開始循環跑起來。水流動過程中不但可以揮發氯等物質，還可以在流動中從水面帶入水中空氣形成水溶氧，依照南北方水質不同跑水時間北方略長（其中包含第2條加溫培菌時間）。

根據所養魚只品種不同提前用加熱棒把缸內水加之至合適溫度，水溫穩定后下硝化菌，因硝化菌在溫度波動時可能導致大量死亡不易于消化系統建立。記住！缸里必須要有溫度計……即便你水養的再好溫度和菌再穩定不過水都有可能產生嚴重后果！新魚入缸相當于給魚換了全部的生存環境，水質水溫震蕩過大都會對魚產生嚴重影響。

第一步泡袋，把魚袋泡到魚缸中讓內外水溫逐步一致，例如野生魚20分鐘左右，人工魚10-15分鐘，可減少水溫變化對魚只產生的影響。第二步過水，準備過水容器如臉盆或小桶，把魚袋中連魚帶水倒入容器，再用一根細軟管例如氣泵管將缸內水緩慢注入過水容器，讓魚慢慢接受魚缸內水質情況。等到魚缸緩慢注入的水多過袋中水兩~三倍以上的時候就比較安全了，這時候可以將魚撈入缸中，過水完成。

第一步泡袋，把魚袋泡到魚缸中讓內外水溫逐步一致，例如野生魚20分鐘左右，人工魚10-15分鐘，可減少水溫變化對魚只產生的影響。第二步過水，準備過水容器如臉盆或小桶，把魚袋中連魚帶水倒入容器，再用一根細軟管例如氣泵管將缸內水緩慢注入過水容器，讓魚慢慢接受魚缸內水質情況。等到魚缸緩慢注入的水多過袋中水兩~三倍以上的時候就比較安全了，這時候可以將魚撈入缸中，過水完成。