深圳站，位于深圳市羅湖區南湖街道建設路1003號，是中國鐵路廣州局集團有限公司管轄的一等站，為深圳鐵路樞紐的重要組成部分，是中國鐵路的大型口岸車站之一，也是廣深鐵路城際列車的始發終到站之一。

深圳坪山站位于中國廣東省深圳市坪山區西部與龍崗區東部交界處，隸屬于中國鐵路廣州局集團有限公司，為廈深鐵路的客運二等站，也是深圳市東部片區的交通樞紐。深圳坪山站于2012年動工建設，原稱深圳新城站；于2013年11月改名深圳坪山站；于2013年12月28日竣工運營。

深圳北站位于廣東省深圳市龍華區民治街道，由中國鐵路廣州局集團有限公司管轄，是深圳鐵路“四主四輔”客運格局的核心車站，也是廣深港高速鐵路中間樞紐站和杭深鐵路的始發站。深圳北站建筑總面積為182074平方米，為地上兩層結構，總高度43.602米。其中，房屋建筑面積74573平方米，站前平臺：34146平方米，主體屋面南北側懸挑：4292平方米，無站臺柱雨棚：68488平方米（鋼結構覆蓋面積），站房屋蓋長413米，寬208米，投影面積約85000平方米。

深圳西站（亦稱南頭火車站、南頭火車西站），位于深圳市南山區學府路與月亮灣大道交界處靠近南頭檢查站，隸屬中國鐵路廣州局集團有限公司平南公司管轄，三等站。2016年1月9日，深圳西站開出最后一趟前往信陽的1204次列車。這趟橫跨三個鐵路局、行經四個省份、距離1532公里的綠皮火車，也是中國南方最后一趟圖定的長途綠皮車。取而代之的是采用新型空調車廂的K824次，始發站也將改為深圳東站。